一、立案阶段。凡发现或者接到举报、控告、移送、上级交办、主动交代等违反林业法律、法规、规章的行为，应当填写《林业行政处罚登记表》，报行政负责人审批。对认为需要给予林业行政处罚的，在七日内予以立案;对认为不需要给予林业行政处罚的，不予立案。
二、调查阶段。 林业行政执法人员调查处理林业行政处罚案件时，应当向当事人或者有关人员出示执法证件。调查处理林业行政处罚案件不得少于二人。 林业行政执法人员应当全面、公正、客观地收集、调取各种证据。林业行政执法人员调查处理林业行政处罚案件应当询问当事人或者其他知情人(以下称被询问人)，并制作《林业行政处罚询问笔录》。林业行政执法人员对与违法行为有关的场所、物品可以进行勘验、检查。必要时，可以指派或者聘请具有专门知识的人进行勘验、检查，并可以邀请与案件无关的见证人和有关的当事人参加。为解决林业行政处罚案件中某些专门性问题，林业行政主管部门可以指派或者聘请有专门知识的人进行鉴定。
三、审查阶段。 林业行政执法人员在调查处理林业行政处罚案件时应当依法收取证据，证据必须经过查证属实，才能作为认定案件事实的根据。公民、法人或者其他组织违反林业行政管理秩序的行为，依法应当给予林业行政处罚的，林业行政主管部门必须查明事实;违法事实不清的，不得给予林业行政处罚。
四、告知阶段。 当事人有权进行陈述和申辩。林业行政主管部门必须充分听取当事人的意见，对当事人提出的事实、理由和证据，应当进行复核;当事人提出的事实、理由或者证据成立的，林业行政主管部门应当采纳。林业行政主管部门不得因当事人申辩而加重处罚。
五、决定阶段。凡决定给予林业行政处罚的，应当制作《林业行政处罚决定书》。按照规定格式载明下列事项: (一)当事人的姓名或者名称、地址;(二)违反法律、法规或者规章的事实和证据;(三)林业行政处罚的种类和依据;(四)林业行政处罚的履行方式和期限;(五)不服林业行政处罚决定，申请行政复议或者提起行政诉讼的途径和期限;(六)作出林业行政处罚决定的林业行政主管部门名称和作出决定的日期。
六、送达阶段。《林业行政处罚决定书》应当及时送达被处罚人，并由被处罚人在《林业行政处罚送达回证》上签名或者盖章;被处罚人不在，可以交给其成年家属或者所在单位的负责人员代收，并在送达回证上签名或者盖章。
七、执行阶段。《林业行政处罚决定书》送达后，承办人应当将案件材料立卷。林业行政处罚案件卷宗一般包括:卷皮、目录、案件登记表、证据材料、林业行政处罚意见书、林业行政处罚决定书和其他材料。林业行政处罚案件办理终结，承办人应当根据一案一卷的原则，将案件的全部材料立卷归档。